安装并配置Ubuntu系统

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Jingyi 6月 01, 2020

　　我最近要跑几个神经网络模型。有个模型需要在Linux环境下执行，我因此安装并配置了Ubuntu系统。简要记录一下过程。

安装Ubuntu

　　我目前这台实验室电脑的前任主人装了Windows和Linux双系统，我接手之后删除了Linux系统。这导致了许多奇怪的问题，例如在Win 10系统下安装CUDA 10.2会导致闪屏等。为了解决这些问题，我选择删除旧系统，改装Ubuntu。

　　安装过程相当简单明了，简要记录如下。

　　1. 从官网或镜像站下载系统文件（ISO格式）。

　　2. 使用Rufus刻录ISO文件，将U盘设置成启动盘。

　　3. 将U盘插入电脑，根据指引程序安装。

注意：

　　1. 如果是用来跑神经网络，尽量选择Ubuntu 18.04.03或18.04.01版本。Ubuntu的其他版本不支持CUDA 10.2，只能装CUDA 9.2。

　　2. Rufus刻录文件时会清空U盘，所以执行操作前请务必做好备份。

　　3. Installation types列出了多个选项，请按照实际情况选择。我这里选择了”Ease disk and install Ubuntu”。

　　安装完成后，Windows环境下还原U盘：

#打开磁盘管理系统

diskpart

　　在磁盘管理系统中查看硬盘信息：

list disk

　　格式化Ｕ盘：

select disk 2
clean

　　然后进入磁盘管理面板，右键U盘，选择新建简单卷。引导界面出现后，点击“下一步”直至完成。

配置软件

　　软件安装需要遵循一定的顺序，不然会有点麻烦。

Anaconda

安装

　　官网给出了详细教程，一步步执行就可以了。我用的是校园网，所以从TUNA镜像站下载Conda安装包，并将其拷贝至电脑上。流程大致如下。

　　Install dependency.

sudo apt update
sudo apt-get install libgl1-mesa-glx libegl1-mesa libxrandr2 libxrandr2 libxss1 libxcursor1 libxcomposite1 libasound2 libxi6 libxtst6

　　Install Anaconda for Python 3.7.

bash ~/Downloads/Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh

　　Verify data integrity with SHA-256 (optional).

sha256sum /path/filename

　　然后一路ENTER，遇到yes/no时输入yes就可以了。注意不要安装VSCode。

　　要退出Base环境，执行

conda deactivate

配置清华源　　

　　新建condarc文件：

nano ~/.condarc

　　粘贴以下内容：

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
channel_alias: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

　　CTRL + O保存， CTRL + X退出nano。重启Terminal。

　　清除缓存，检查是否配置正确：

conda clean -i
conda config --show-sources  # 显示所有源

配置环境

　　配置python 3.6.7 环境：

conda create -n py36 python=3.6.7

Trojan

　　CUDA 10.2需要从国外源下载软件，所以要先配置好代理。

# 下载
wget https://github.com/trojan-gfw/trojan/releases/download/v1.14.1/trojan-1.14.1-linux-amd64.tar.xz

# 解压
tar -xvf  trojan-1.14.1-linux-amd64.tar.xz

# 切换到 Trojan 客户端的目录
cd trojan

#配置代理信息, CTRL + O保存
nano config.json

　　运行Trojan:

#前台运行
sudo ./trojan 

#后台运行
sudo ./trojan &

　　终止进程：

pkill -f  trojan

CUDA 10.2

　　对于Ubuntu系统而言，NVIDIA CUDA 10.2只支持Ubuntu 18.04.3和Ubuntu 16.04.6系统。

Pre-installation Actions

　　检查软硬件版本。对Ubuntu 18.04.3系统， CUDA要求的软件版本如下表。其他系统对应的软件要求请查询官方文档。

软件名称 版本
Kernel 4.15.0
GCC 7.3.0
GLIBC 2.27
ICC 19.0
PGI 18.x, 19.x
XLC NO
CLANG 8.0.0

　　执行以下命令：

# Verify your GPU
lspci | grep -i nvidia

# Verify linux version
uname -m && cat /etc/*release

# Check gcc version
gcc --version

# Verify kernel version
uname -r

安装gcc

　　为安装7.3.0版本，下载并解压安装包，安装在Home中。

ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/releases/gcc-7.3.0/gcc-7.3.0.tar.gz #下载地址

　　我这边网络不行，需要预先下载，手动编译。进入 gcc 源码包目录下 ，编辑 ./contrib/download_prerequisites，查看版本号：

gmp = 'gmp-6.1.0.tar.bz2'
mpfr = 'mpfr-3.1.4.tar.bz2'
mpc = 'mpc-1.0.3.tar.gz'
isl = 'isl-0.15.1.tar.bz2'

　　对应的下载地址：

https://ftp.gnu.org/gnu/gmp/gmp-6.1.0.tar.bz2
https://ftp.gnu.org/gnu/mpfr/mpfr-3.1.4.tar.bz2
https://ftp.gnu.org/gnu/mpc/mpc-1.0.3.tar.gz
https://gcc.gnu.org/pub/gcc/infrastructure/isl-0.16.1.tar.bz2

　　将其拷贝至 ~/gcc-7.3.0目录下，执行以下命令

./contrib/download_prerequisites

　　创建目录并编译（这步需要1个多小时）：

mkdir gcc-temp
cd gcc-temp
../configure --enable-checking=release --enable-languages=c,c++ --disable-multilib

　　编译完成后，执行

make
sudo make install

　　检查gcc版本：

gcc -v

　　Done!

更换内核

　　查看可安装的内核：

sudo apt-cache search linux-image | grep generic

　　下载指定版本的内核：

sudo apt-get install linux-image-4.15.0-101-generic

　　查看系统可用的 Linux 内核：

grep menuentry /boot/grub/grub.cfg

　　修改Grub，设置内核启动版本.打开 grub 文件：

sudo nano /etc/default/grub

　　注意：不建议在root模式下使用GUI（如gredit），这样可能会导致下载目录混乱。详细论述请参阅这里：Why should users never use normal sudo to start graphical applications?

　　将GRUB_DEFAULT=0 （0代表系统当前启动的内核序号）改为修改为想要启动的内核版本对应子选项。例如1 <4。选项确认参考：

 vim /boot/grub/grub.cfg

menuentry 'Ubuntu'{...}
submenu 'Advanced options for Ubuntu'{
    menuentry 'Ubuntu, with Linux 3.19.0-25-generic'{..}
    menuentry 'Ubuntu, with Linux 3.19.0-25-generic'(recovery mode){..}
    ....
}
# 上图表示格式为
0--ubuntu
1--Advanced options for Ubuntu
    0--Ubuntu, with Linux 3.19.0-25-generic
    1--menuentry 'Ubuntu, with Linux 3.19.0-25-generic'(recovery mode)
    2 ....

　　更新Grub:

sudo grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg

　　无错误提示，即可reboot重启系统。

　　重启后查看内核版本：

sudo reboot
uname -r

　　我重启后发现屏幕分辨率和刷新率都不对（分辨率只有640*480）。更改分辨率：

sudo nano /etc/default/grub

　　将#GRUB_GFXMODE=640x480改成你想要的分辨率，例如

GRUB_GFXMODE=1024x768

　　CTRL + O保存，然后更新文件：

sudo grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg

#或者
sudo update-grub

#重启系统
sudo reboot

　　更改刷新率：

# 格式是分辨率_刷新率
xrandr -s 1920*1080_60.00

　　显示问题修好之后，我发现机子上不了网。。。具体来说，GUI显示Wfi adaptor not found。最初怀疑是驱动问题，换回旧内核更新驱动，无效。使用新内核，手机USB链接电脑使用data tethering（不需要安装驱动），无反应。Fresh install系统之后，切换到4.15.0内核还是连不上网。后来注意到开机有条ERROR一闪而过。怀疑是网络层出问题，或者软硬件不兼容。这个bug倒腾了两天，没修好。我这边没有网线，

所以这台电脑完全处于离线状态，啥都干不了。

　　记录一下该电脑的参数，以作参考。

电脑型号 Dell XPS 8930
CPU Intel Core i7-8700@3.20GHz
显卡 NVIDIA GeForce GTX 1070
WIFI适配器 Qualcomm Atheros QCA6174 802.11ac

　　谷歌一圈，发现Linux下装CUDA是真的麻烦…Stack Exchange上有人折腾了几周都没弄好。所以准备换回Windows，然后远程连接实验室的Linux工作站了。

　　重装Windows的流程与Linux类似。注意在选择系统安装盘时，需要删除Linux创建的磁盘分区后再选择。重装后如果看不到哪个磁盘，点击“磁盘管理器”，新建简单卷即可。

Reference

  1. WikiHow: 如何安装Ubuntu Linux
  2. U盘启动安装Linux系统
  3. U盘启动盘怎么复原为普通U盘
  4. TUNA: 清华大学开源软件镜像站
  5. Anaconda Documentation - Installing on Linux
  6. TUNA: Anaconda 镜像使用帮助
  7. Ubuntu 16.04 安装Anaconda并换源
  8. Trojan-Github
  9. NVIDIA CUDA Installation Guide for Linux
  10. 手动更新gcc
  11. Makefile:252: recipe for target ‘install’ failed - Stack Exchange
  12. 如何降级/切换 Ubuntu 系统 Linux 内核启动版本
  13. Ubuntu 切换内核
  14. Ubuntu系统分辨率只有640*480 的解决办法
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